Suların dezenfeksiyonun da klor verici maddeler kullanılır.

Şehir şebekesi suları gibi büyük miktarlardaki suyun dezenfeksiyonun da klorinatör denilen cihazlarla su içerisine gaz şeklinde klor verilir. Etkin bir klorlama da, klorlama işleminden bir saat sonra klorlanmış suda, litrede 0.2 mg bağımsız klor bulunması gerekir.

Az miktarda suyun klorlanması için önce %1 oranında bağımsız klor içeren ana eriyik hazırlanır. Bunun için 1 litre suya toz kireç kaymağından 40 gr ya da ev temizliği için kullanılan klordan 250 mg eklenir. Hazırlanan bu ana çözeltiden bir litre suya üç beş damla karıştırılır. Yeterli dezenfeksiyon sağlanması için en az yirmi dakika beklenmesi gerekir.

Bağırsak enfeksiyonlarının salgıları sırasında, sebze ve meyvelerin yıkanması amacıyla kullanılacak suya bu miktarın 10 katı yoğunlukta klor katılır.